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O incentivo à pesquisa, à extensão e à produção científica e tecnologia será oferecido por meio dos seguintes programas institucionais:

a) Programa Institucional de Incentivo à Produção Científica e Inovação Tecnológica (PIPCIT), focado no apoio aos discentes e servidores interessados no desenvolvimento de produção científica e de inovação tecnológica;

b) Programa Institucional de Bolsas de Iniciação em Desenvolvimento Tecnológico e Inovação (Pibiti), criado pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) no sentido de estimular estudantes do ensino superior ao desenvolvimento e transferência de novas tecnologias e inovação.

c) Programa Institucional de Apoio a Projetos de Extensão do IFSC, que apoia as atividades de extensão, regulamentadas por resoluções internas específicas,  com ênfase em atividades acadêmicas que contribuam para o acesso ao saber e a diminuição das desigualdades sociais, bem como ao fortalecimento da extensão como atividade institucional;

d) Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica (Pibic/CNPq), que visa apoiar a política de iniciação científica desenvolvida na instituição, por meio da concessão de bolsas de iniciação científica a estudantes de graduação integrados na pesquisa científica;

e) Programa Institucional de Bolsa de Iniciação à Docência (Pibid), iniciativa para o aperfeiçoamento e a valorização da formação de professores para a educação básica.